20. 중합효소연쇄반응과 회전환 증폭을 이용한 타겟 핵산서열 검출 (김동은, 김동민. 2020.07.01 등록번호 10-2131494)

19. 폴리에틸렌글리콜 접합된 나노 사이즈의 산화그래핀을 포함하는 PCR용 조성물 (김동은, 김효령, 백아름. 2018.08.05: 등록번호 10-1897490)

18. 회전환 증폭을 이용한 miRNA의 형광 검출 방법 (김동은, 홍채선, 김동민. 2018.05.08: 등록번호 10-1857603)
 

11. 산화그래핀 및 요소를 이용한 핵산의 분리방법 

     (김동은, 박준수. 2014.09.12: 등록번호 10-1442418)

10. HA1에 특이적으로 결합하는 RNA 앱타머 및 조류인플루엔자 바이러스에 대한 응용. 

    (김동은. 2014.01.10: 등록 번호 10-1352430)

9. C형 간염 바이러스 헬리카제 및 RNA 복제효소의 활성을 동시에 저해하는 케르세틴 유도체. 

    (정유훈, 김동은. 2013.07.30: 등록번호 10-1293249)

8. 나노입자-기반된 유전자 운반체. 

    (한민수, 이강석, 김동은. 2013.02.01: 등록번호 10-1230913)

7. 인터류킨-32 길항적 RNA 앱타머. 

    (김동은, 윤도영, 김세호, 김정희. 2011.11.30: 등록 번호 10-1090177)

6. 중증급성호흡기증후군 코로나바이러스(SCV)에 대한 저해활성을 가지는 조성물. 

    (김동은, 정용주, 장경진, 여운석. 2011.09.29: 등록번호 10-1070654)

5. C형 간염 바이러스 RNA 핵산 중합효소 (RNA-dependent RNA polymerase, HCV RdRp)의 활성을 저해하는 신규 플라보놀 유도체 (정유훈, 김동은, 김진영, 김기선. 2011.09.21: 등록번호 10-1068160)

4. TEL-AML1 키메릭 mRNA를 특이적으로 절단하는 핵산 분자. 

    (김동은, 최우형, 최보라. 2011.07.01: 등록번호 10-1047529, 10-1047530)

3. 비뉴클레오시드 계열의 C형 간염 치료 또는 예방제 (박형순, 이수재, 정유훈, 김동은. 2011.05.19: 등록번호 10-1037178)

​

2. RNA 절단 DNA자임, 그것의 라이브러리 및 타겟 자리 선택 방법. 

    (김동은, 김기선, 오상택, 김재현. 2007.10.11: 등록번호 10-0768258)

1. 폴리감마글루탐산을 생산하는 신규한 바실러스속 YN-1균주와 이를 이용한 폴리감마글루탐산의 제조방법

    (권현주, 김병우, 김동은, 남수완, 전숭종, 김영만, 유경옥. 2007.05.04: 등록번호 10-0717169)